MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 8007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019957	CGG	2	6	153	158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644116
2	NC_019957	TC	3	6	222	227	0 %	50 %	0 %	50 %	433644117
3	NC_019957	GAACGT	2	12	264	275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433644117
4	NC_019957	GGGCC	2	10	344	353	0 %	0 %	60 %	40 %	433644117
5	NC_019957	ACC	2	6	423	428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644117
6	NC_019957	ACG	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644117
7	NC_019957	ACAG	2	8	561	568	50 %	0 %	25 %	25 %	433644117
8	NC_019957	TTC	2	6	645	650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644117
9	NC_019957	GCCG	2	8	659	666	0 %	0 %	50 %	50 %	433644117
10	NC_019957	GCG	2	6	690	695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644117
11	NC_019957	CGG	2	6	948	953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644117
12	NC_019957	GAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644117
13	NC_019957	CCA	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644117
14	NC_019957	TTGC	2	8	1164	1171	0 %	50 %	25 %	25 %	433644117
15	NC_019957	CCGGC	2	10	1245	1254	0 %	0 %	40 %	60 %	433644118
16	NC_019957	CCA	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644118
17	NC_019957	CAG	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
18	NC_019957	TCG	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
19	NC_019957	GCAC	2	8	1381	1388	25 %	0 %	25 %	50 %	433644118
20	NC_019957	GCAG	2	8	1407	1414	25 %	0 %	50 %	25 %	433644118
21	NC_019957	TCG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
22	NC_019957	TCC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644118
23	NC_019957	CTA	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644118
24	NC_019957	GC	3	6	1543	1548	0 %	0 %	50 %	50 %	433644118
25	NC_019957	GAT	2	6	1615	1620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644118
26	NC_019957	CAC	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644118
27	NC_019957	AAC	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644118
28	NC_019957	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644118
29	NC_019957	GT	3	6	1750	1755	0 %	50 %	50 %	0 %	433644118
30	NC_019957	CG	3	6	1784	1789	0 %	0 %	50 %	50 %	433644118
31	NC_019957	CGG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644118
32	NC_019957	TCG	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
33	NC_019957	CGG	2	6	1857	1862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644118
34	NC_019957	GTC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
35	NC_019957	GGAT	2	8	2114	2121	25 %	25 %	50 %	0 %	433644118
36	NC_019957	GGC	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644118
37	NC_019957	TCT	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644118
38	NC_019957	ACG	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
39	NC_019957	CCA	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644118
40	NC_019957	TG	3	6	2471	2476	0 %	50 %	50 %	0 %	433644118
41	NC_019957	TC	3	6	2479	2484	0 %	50 %	0 %	50 %	433644118
42	NC_019957	GTA	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644118
43	NC_019957	ACG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
44	NC_019957	CCTA	2	8	2586	2593	25 %	25 %	0 %	50 %	433644118
45	NC_019957	CGA	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
46	NC_019957	CGGCG	2	10	2638	2647	0 %	0 %	60 %	40 %	433644118
47	NC_019957	CGT	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644118
48	NC_019957	CGA	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644118
49	NC_019957	CAGGC	2	10	2793	2802	20 %	0 %	40 %	40 %	433644118
50	NC_019957	CATG	2	8	2926	2933	25 %	25 %	25 %	25 %	433644119
51	NC_019957	GC	3	6	2963	2968	0 %	0 %	50 %	50 %	433644119
52	NC_019957	GTG	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644119
53	NC_019957	GTC	3	9	3062	3070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644119
54	NC_019957	TTC	2	6	3080	3085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644119
55	NC_019957	TGT	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644119
56	NC_019957	TGC	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644119
57	NC_019957	GGC	2	6	3250	3255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
58	NC_019957	CCG	2	6	3297	3302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644119
59	NC_019957	CGAG	2	8	3383	3390	25 %	0 %	50 %	25 %	433644119
60	NC_019957	GAT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644119
61	NC_019957	CGG	2	6	3577	3582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
62	NC_019957	CAA	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644119
63	NC_019957	GCC	2	6	3594	3599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644119
64	NC_019957	GA	3	6	3640	3645	50 %	0 %	50 %	0 %	433644119
65	NC_019957	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644119
66	NC_019957	ACT	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644119
67	NC_019957	TGG	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644119
68	NC_019957	GTCG	2	8	3802	3809	0 %	25 %	50 %	25 %	433644119
69	NC_019957	TTC	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644119
70	NC_019957	TCG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644119
71	NC_019957	TGCC	2	8	3966	3973	0 %	25 %	25 %	50 %	433644119
72	NC_019957	GCG	2	6	4057	4062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
73	NC_019957	GC	3	6	4064	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	433644119
74	NC_019957	GCG	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644119
75	NC_019957	GCC	2	6	4171	4176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644119
76	NC_019957	GAT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644120
77	NC_019957	TGG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644120
78	NC_019957	GCG	2	6	4574	4579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644120
79	NC_019957	CGA	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644120
80	NC_019957	TCA	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644120
81	NC_019957	GCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644120
82	NC_019957	ACT	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644120
83	NC_019957	GTC	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644120
84	NC_019957	TTG	2	6	4886	4891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644120
85	NC_019957	AGAT	2	8	4911	4918	50 %	25 %	25 %	0 %	433644120
86	NC_019957	TGG	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644120
87	NC_019957	CAT	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644120
88	NC_019957	TCG	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644120
89	NC_019957	GGT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644120
90	NC_019957	CGC	2	6	5210	5215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644120
91	NC_019957	TTGC	2	8	5640	5647	0 %	50 %	25 %	25 %	433644121
92	NC_019957	GAC	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644121
93	NC_019957	CTA	2	6	5721	5726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644121
94	NC_019957	TGG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644121
95	NC_019957	GGTC	2	8	5762	5769	0 %	25 %	50 %	25 %	433644121
96	NC_019957	CTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
97	NC_019957	CTG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
98	NC_019957	CGG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644121
99	NC_019957	TG	3	6	5904	5909	0 %	50 %	50 %	0 %	433644121
100	NC_019957	TCT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
101	NC_019957	TCAT	2	8	5978	5985	25 %	50 %	0 %	25 %	433644121
102	NC_019957	CCA	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
103	NC_019957	CGC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644121
104	NC_019957	GCG	2	6	6040	6045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644121
105	NC_019957	ATC	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644121
106	NC_019957	CGG	2	6	6169	6174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644121
107	NC_019957	GCA	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644121
108	NC_019957	GC	3	6	6250	6255	0 %	0 %	50 %	50 %	433644121
109	NC_019957	CAC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
110	NC_019957	CAC	2	6	6312	6317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
111	NC_019957	AC	3	6	6319	6324	50 %	0 %	0 %	50 %	433644121
112	NC_019957	TCG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
113	NC_019957	ACC	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644121
114	NC_019957	TCT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
115	NC_019957	TGG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644121
116	NC_019957	CTTT	2	8	6431	6438	0 %	75 %	0 %	25 %	433644121
117	NC_019957	GAA	2	6	6506	6511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644121
118	NC_019957	CTG	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
119	NC_019957	CAT	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644121
120	NC_019957	TCT	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644121
121	NC_019957	CGT	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
122	NC_019957	GTC	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
123	NC_019957	TGC	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644121
124	NC_019957	GTC	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644122
125	NC_019957	GGT	2	6	7000	7005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
126	NC_019957	GAG	2	6	7031	7036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644122
127	NC_019957	CGG	2	6	7146	7151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644122
128	NC_019957	GTC	2	6	7181	7186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644122
129	NC_019957	GTG	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
130	NC_019957	CGG	2	6	7218	7223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644122
131	NC_019957	GGT	2	6	7234	7239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
132	NC_019957	GT	4	8	7265	7272	0 %	50 %	50 %	0 %	433644122
133	NC_019957	CG	3	6	7331	7336	0 %	0 %	50 %	50 %	433644122
134	NC_019957	TC	3	6	7352	7357	0 %	50 %	0 %	50 %	433644122
135	NC_019957	AGG	2	6	7377	7382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644122
136	NC_019957	CA	3	6	7493	7498	50 %	0 %	0 %	50 %	433644122
137	NC_019957	GATC	2	8	7504	7511	25 %	25 %	25 %	25 %	433644122
138	NC_019957	TCA	2	6	7539	7544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644122
139	NC_019957	TCT	2	6	7596	7601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644122
140	NC_019957	TGG	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644122
141	NC_019957	CGA	2	6	7711	7716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644122
142	NC_019957	GTCCG	2	10	7730	7739	0 %	20 %	40 %	40 %	433644122
143	NC_019957	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644123
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145	NC_019957	GCTG	2	8	8416	8423	0 %	25 %	50 %	25 %	433644123
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148	NC_019957	TTG	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644123
149	NC_019957	GCT	3	9	8671	8679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644123
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152	NC_019957	GATCGG	2	12	8849	8860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433644123
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155	NC_019957	GCTC	2	8	8932	8939	0 %	25 %	25 %	50 %	433644123
156	NC_019957	GCC	2	6	8961	8966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644123
157	NC_019957	GCC	2	6	8984	8989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644123
158	NC_019957	TC	3	6	9009	9014	0 %	50 %	0 %	50 %	433644123
159	NC_019957	CG	3	6	9043	9048	0 %	0 %	50 %	50 %	433644123
160	NC_019957	CGA	3	9	9055	9063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644123
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168	NC_019957	GGT	2	6	9597	9602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644124
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173	NC_019957	TCGT	2	8	9775	9782	0 %	50 %	25 %	25 %	433644124
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244	NC_019957	GTCGG	2	10	13778	13787	0 %	20 %	60 %	20 %	433644127
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249	NC_019957	GC	3	6	14058	14063	0 %	0 %	50 %	50 %	433644127
250	NC_019957	GAA	2	6	14077	14082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644127
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253	NC_019957	TGC	2	6	14391	14396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644128
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257	NC_019957	CGC	2	6	14533	14538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644128
258	NC_019957	CAA	2	6	14554	14559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644128
259	NC_019957	ACT	2	6	14574	14579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644128
260	NC_019957	CGG	2	6	14602	14607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644128
261	NC_019957	CGG	2	6	14703	14708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644128
262	NC_019957	TGA	2	6	14712	14717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644128
263	NC_019957	GAA	2	6	14728	14733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644128
264	NC_019957	TTC	2	6	14789	14794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644128
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268	NC_019957	GAC	2	6	14962	14967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644128
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391	NC_019957	GCC	2	6	26743	26748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
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497	NC_019957	GCC	2	6	31765	31770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644138
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500	NC_019957	CTTCG	2	10	31843	31852	0 %	40 %	20 %	40 %	433644138

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